Wojna, która wybuchła w 1999 roku w Kosowie spowodowała masowe ucieczki ludności cywilnej do sąsiedniej Albanii. To wydarzenie stało się bezpośrednim impulsem do powstania Polskiej Misji Medycznej.
19 kwietnia 1999 r. wyjechała do Albanii Polska Misja Medyczna, której celem było stworzenie polowego szpitala dla uchodźców z Kosowa. Zespół składał się z 14 przeszkolonych medycznie strażaków z Grupy Poszukiwawczo-Ratowniczej Państwowej Straży Pożarnej w Nowym Sączu, 5 lekarzy, pielęgniarza i tłumaczki. Zabrali trzy samochody ratownicze wyposażone m.in. w agregaty prądotwórcze i stacje uzdatniania wody, ambulans i 28-tonowy tir z namiotami, sprzętem medycznym, materiałami opatrunkowymi, lekami i odżywkami dla dzieci.
W obozach dla uchodźców w Lac oraz w Ndroq powstał pierwszy w historii polski szpital polowy. Stworzyli go lekarze naszej Misji wraz z lekarzami ze stowarzyszenia Lekarze Nadziei i ratownikami medycznymi Państwowej Straży Pożarnej. Zespoły wyjazdowe działały także w kilkunastu innych obozach dla uchodźców będąc w stałej dyspozycji tysięcy uchodźców. Szpital był wspierany przez polski rząd, firmy farmaceutyczne i organizacje pozarządowe.
W ramach szpitala funkcjonowała sala zabiegowo - operacyjna, ambulatorium internistyczne, chirurgiczne, pediatryczne i położniczo - ginekologiczne. Działała izba chorych, laboratorium i apteka. W skład całości wchodził także system ratownictwa medycznego i pomocy doraźnej.
W czasie 5 miesięcy swej działalności szpital udzielił pomocy ponad 20 tysiącom ludzi, a jego działalność została bardzo wysoko oceniona przez miejscowe władze i przedstawicieli organizacji humanitarnych.
Główne problemy z jakimi zmagali się uchodźcy to infekcje dróg oddechowych, schorzenia dermatologiczne, infekcje przewodu pokarmowego, zaostrzenia chorób przewlekłych związane z przerwą w leczeniu. Dużym problemem były odmrożenia, rany i uszkodzenia kostno-stawowe, spowodowane górską wędrówką.
Projekt zrealizowano przy udziale organizacji Action by Churches Together(ACT) ze Światowej Rady Kościołów w Genewie. Skandynawska Akcja Zjednoczonych Kościołów zajmowała się Albanii prowadzeniem obozów dla uchodźców.
